X

Technelysium Chromas Pro v1.7.7

Engineering Applications

 
  • تصفية
  • الوقت
  • عرض
مسح الكل
مشاركات جديدة




    برنامج
    Technelysium Chromas Pro v1.7.7







    ChromasPro is suitable for sequencing projects up to a few megabases, and basic sequence editing and analysis. It is able to assemble data from 454 and Illumina next-generation sequencers, with up to 100,000 sequences if 2 Gb RAM is available. ChromasPro has the following features

    PHP Code:


        Open 
    and save sequences in Applied BiosystemsStaden Chromatogram (SCF), MegaBace (.esd), 454 SFFFASTAFASTQEMBLGenBankSwissProtGenPeptGCG RSF and plain text formats.
        
    Assemble overlapping sequences into a consensus and automatically display ambiguities for editing.
        Use 
    quality data to automatically remove low quality sequence and improve sequence assembly.
        
    View Genescan genotype files (only older format files are currently supported).
        
    Generate restriction site and fragment maps, and list cuttersnon-cutters and fragments.
        
    Map open reading framesaided by a G+C frame plot, and translate ORFs with one click.
        Print 
    chromatogramsrestriction site and fragment maps, and open reading frame maps.
        
    Perform nucleotide and protein BLAST searches through the NCBI web site.
        
    Perform multiple alignments by interfacing with ClustalW.
        
    Reverse complement sequences and chromatograms.
        
    Search for sequences by exact matching or optimal alignment.
        
    Display translations when editing nucleotide sequences.
        
    Perform reverse translations and plot nucleotide degeneracy.
        
    Plot hydrophilicity and antigenicity of proteins.
        
    Copy an image of a chromatogram section for pasting into documents or presentations


    1.2MB
    *


Working...
X